Séances en salle informatique
Objectif des séances pratiques :
analyse statistique utilisant EXCEL et R
- Fonctions de calcul de base et fonctions statistiques sous EXCEL
- Présentation des données expérimentales
- Gestion des erreurs
- Représentation graphique (synthèse statistique, liaison statistique entre variables ...)
- Application des fonctions associées aux lois de distribution
- Statistiques descriptives (réduction des données, graphes et calculs)
- Tests d'hypothèse (dont ANOVA à 1 ou 2 facteurs)
- Apprentissage dy logiciel R et application aux calculs et aux tests statistiques
- Recherche de maximum de vraisemblance
- Traitement de l'information d'une base de données de grande dimension
Avantage d'EXCEL : présentation personnalisée des données
Inconvénients : tests pas toujours aisés à réaliser (et certains tests ne sont pas possibles avec la version de base)
Avantage de R : tests précis, immédiats et faciles à programmer
Inconvénients : bien qu'assez complète, la présentation des résultats est sommaire
Pour ces raisons, nous utilisons les 2 logiciels en séances informatique
Travail sur les ordinateurs (présentation vidéo)
Prise en main du logiciel R (présentation vidéo)
Prise en main du logiciel Scilab (présentation vidéo)
Le coin des documents spécifiques aux séances 2013
Les séances en un seul clic
Organisation du travail : vous allez comprendre au fil du temps que la meilleure façon de procéder est de créer un répertoire où vous rangerez vos scripts R, un autres ou vous rangerez vos données brutes, un autre répertoire pour les résultats et enfin un répertoire pour sauvegarder les ichiers images résultant de l'analyse graphique....
conseil : consulter la partie "Examen Pratique" (onglet "Contrôle des connaissances") et s'entraîner sur les problèmes proposés (travail en groupe de 2 à 4 étudiants conseillé)
Toutes les séances en salle informatique
A/ Introduction et Statistique descriptive (4 séances)
Documents relatifs aux séances consacrées à la statistique descriptive
Plan des séances
Tutoriaux
Fichiers de données utilisés (également téléchargeables dans la rubrique "Fichiers Sources")
Scripts de commandes R
Environnements de travail complets
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Tous les fichiers créés lors de la 2ème séance (fichier compressé Zip) |
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Tous les fichiers créés lors de la 2ème séance organisés en répertoires (fichier compressé Zip) |
Fichiers EXCEL
B/ Lois de Probabilités
Documents relatifs aux séances consacrées aux Lois de Probabilités
Tutoriaux
Scripts de commandes R
Fichiers EXCEL
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Lois de probabilités usuelles (fichier Excel) |
Exercices
(travail conseillé mais non obligatoire)
1 - A partir de votre fichier numérique "Culture bio"
a/ Déterminer avec EXCEL les différents quartiles de la distribution (données brutes)
b/ Réalisez le diagramme en boîte à moustaches de la distribution des valeurs
c/ Faites ce même travail avec le logiciel RA partir du fichier suivant
2 - A partir du fichier Fichier inhibition enzyme (fichier txt)
Réaliser la courbe de l'activité enzymatique en fonction de la concentration d'inhibiteur, en incluant les barres d'erreurs.
3 - Réalisez un script R permettant de visualiser la tendance Normale de la loi Binomiale lorsque N>5 (en 3 ou 4 courbes superposées)
C/ Jugement sur échantillon (séance réalisée avec EXCEL et le logiciel R)
E-1/ Test du Chi-deux
E-2/ Tests paramétriques
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Listing des tests paramétriques réalisés en séances avec R (fichier WORD) |
D/ ANOVA uni et multifactorielle (séance réalisée avec EXCEL et le logiciel R)
E/ Bases de données en biologie (séance réalisée avec Access)
< De nouveaux exercices pratiques seront proposés au fil du temps> |